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生命科學(xué)行業(yè)解決方案

一站式新藥研發(fā)云平臺(tái)，支持構(gòu)建高效的CADD&AIDD自動(dòng)化流程，提供開(kāi)源/自有分子庫(kù)構(gòu)建與治理服務(wù)

生命科學(xué)解決方案,CADD,AIDD,生信分析,生物化學(xué)計(jì)算

生命科學(xué)行業(yè)白皮書(shū)

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這一屆科研計(jì)算人趕DDL紅寶書(shū)：學(xué)生篇

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AutoDock Vina分子對(duì)接,虛擬篩選生物計(jì)算上云案例,15小時(shí)對(duì)接2800萬(wàn)個(gè)分子

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Amber分子自由能計(jì)算,20小時(shí)155個(gè)GPU計(jì)算Amber分子動(dòng)力學(xué)模擬力場(chǎng)

生信云實(shí)證Vol.6：155個(gè)GPU！多云場(chǎng)景下的 Amber自由能計(jì)算

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應(yīng)用場(chǎng)景

  • 制藥企業(yè)

  • CRO

  • 基因測(cè)序企業(yè)

  • 生物科技企業(yè)

  • 高校/研究機(jī)構(gòu)

  • 醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室

  • 計(jì)算機(jī)輔助新藥研發(fā),虛擬篩選,藥物分子設(shè)計(jì)

    虛擬篩選

    藥效預(yù)測(cè)

    藥物分子
    設(shè)計(jì)

    藥物結(jié)構(gòu)
    優(yōu)化

    預(yù)約演示

業(yè)務(wù)挑戰(zhàn)

  • 計(jì)算流程Workflow定制化需求高

    計(jì)算流程Workflow定制化需求高

    應(yīng)用與流程眾多，公司知識(shí)難以沉淀，復(fù)用率有待提高

    手動(dòng)定制化Workflow，業(yè)務(wù)流程調(diào)整不方便， 應(yīng)用調(diào)優(yōu)困難，執(zhí)行效率低

    無(wú)法可視化拖拽組件，無(wú)法查看中間數(shù)據(jù)

    不同應(yīng)用與底層資源適配不靈活

  • 數(shù)據(jù)庫(kù)構(gòu)建與管理技術(shù)門(mén)檻高

    數(shù)據(jù)庫(kù)構(gòu)建與管理技術(shù)門(mén)檻高

    海量基礎(chǔ)數(shù)據(jù)維護(hù)難（如開(kāi)源分子庫(kù)數(shù)據(jù)整理）

    眾多的內(nèi)外部數(shù)據(jù)分散、不統(tǒng)一，急需有效管理和治理

    核心數(shù)據(jù)缺乏多重安全機(jī)制保障，安全性堪憂(yōu)

    數(shù)據(jù)無(wú)法形成資產(chǎn)，復(fù)用率低

    系統(tǒng)層面缺乏統(tǒng)一的管控和必要的審計(jì)

  • 研發(fā)對(duì)計(jì)算資源需求高

    研發(fā)對(duì)計(jì)算資源需求高

    CADD/AIDD需要大量算力加快篩選過(guò)程和提高模型精度

    研發(fā)項(xiàng)目眾多時(shí)，資源爭(zhēng)搶?zhuān)蝿?wù)排隊(duì)，時(shí)間更長(zhǎng)

    應(yīng)用并行度不足，無(wú)法發(fā)揮現(xiàn)有資源能力

    應(yīng)用需求的計(jì)算多樣化，難以獲取所需的目標(biāo)資源

  • IT環(huán)境維護(hù)難度大

    IT環(huán)境維護(hù)難度大

    多地研發(fā)中心間協(xié)同復(fù)雜，維護(hù)成本高

    統(tǒng)一身份認(rèn)證鑒權(quán)，數(shù)據(jù)應(yīng)用代碼級(jí)別的安全協(xié)同困難

    網(wǎng)絡(luò)傳輸穩(wěn)定性和性能風(fēng)險(xiǎn)對(duì)業(yè)務(wù)存在影響

    在混合云需求下，IT運(yùn)維復(fù)雜，耗費(fèi)較多時(shí)間

預(yù)約專(zhuān)家1對(duì)1咨詢(xún)

為什么選擇速石

  • 生命科學(xué)解決方案,自定可視化Workflow,提升生信行業(yè)研發(fā)效率

    高效的研發(fā)業(yè)務(wù)自動(dòng)化流程構(gòu)建

    自定義構(gòu)建可視化Workflow

    簡(jiǎn)化操作過(guò)程，提高研發(fā)效率

    了解Workflow
  • 生信研發(fā)云平臺(tái),提供Zinc、Drugbank開(kāi)源分子庫(kù),自由能分子庫(kù)

    完善的研發(fā)數(shù)據(jù)庫(kù)管理與配置

    提供Zinc、Drugbank等開(kāi)源/自由分子庫(kù)構(gòu)建與治理服務(wù)

    提供海外站點(diǎn)研發(fā)數(shù)據(jù)庫(kù)高速下載

    了解分子庫(kù)管理
  • aidd平臺(tái),支持AlphaFold,RoseTTAFold,AI應(yīng)用,AI框架,

    專(zhuān)業(yè)的AIDD平臺(tái)定制化建設(shè)

    支持AlphaFold、RoseTTAFold等主流AI應(yīng)用

    支持常見(jiàn)AI框架所需環(huán)境的快速搭建

    支持更多研發(fā)組件按需集成

    了解AlphaFold2了解MLOps平臺(tái)
  • 生信計(jì)算平臺(tái),支持RESTful ,集成第三方生物/化學(xué)計(jì)算環(huán)境

    支持集成內(nèi)外部計(jì)算平臺(tái)與客戶(hù)端

    支持RESTful API業(yè)務(wù)對(duì)接現(xiàn)有客戶(hù)端

    支持在平臺(tái)內(nèi)集成第三方生物/化學(xué)計(jì)算環(huán)境應(yīng)用

  • Cadd計(jì)算平臺(tái),海量異構(gòu)資源,大規(guī)模算力

    智能調(diào)度海量異構(gòu)資源

    提供豐富計(jì)算資源，滿(mǎn)足不同場(chǎng)景的計(jì)算需求

    大規(guī)模算力智能調(diào)度，提升研發(fā)效率，降低成本

    了解Fsched自研調(diào)度器
  • Bio研發(fā)平臺(tái),專(zhuān)業(yè)Bio-IT服務(wù)

    專(zhuān)業(yè)CADD/AIDD能力

    專(zhuān)業(yè)BIO-IT專(zhuān)家團(tuán)隊(duì)輸出能力與經(jīng)驗(yàn)

    支持自動(dòng)化運(yùn)維、監(jiān)控與告警

    了解CSM服務(wù)

有問(wèn)題需要解答？

填寫(xiě)表單獲取更多專(zhuān)業(yè)技術(shù)人員支持

行業(yè)及需求

典型業(yè)務(wù)場(chǎng)景

  • 本地集群化

  • 端到端研發(fā)云

  • 大算力高性?xún)r(jià)比

  • 混合云

本地CADD/AIDD研發(fā)平臺(tái)解決方案

場(chǎng)景說(shuō)明

本地CADD/AIDD計(jì)算平臺(tái)

新藥研發(fā)計(jì)算平臺(tái)

集群化平臺(tái)構(gòu)建

CADD計(jì)算平臺(tái),AIDD計(jì)算平臺(tái),新藥研發(fā)平臺(tái)
預(yù)約演示
相關(guān)產(chǎn)品FCPFsched
服務(wù)支持CSM

行業(yè)案例

蛋白質(zhì) AIDD GPU 人工智能

某藥物研發(fā)公司

應(yīng)用

AlphaFold2

場(chǎng)景

蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)

客戶(hù)挑戰(zhàn)

1本地計(jì)算資源有限，多部門(mén)爭(zhēng)搶?zhuān)瑢?dǎo)致許多任務(wù)被推遲，效率不高

2AlphaFold2需要使用GPU來(lái)加速蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)，在實(shí)際業(yè)務(wù)中最多一次需跑十幾個(gè)任務(wù)，并發(fā)需求多，如果按峰值購(gòu)買(mǎi)GPU卡，一次性投入較高

3研發(fā)只了解應(yīng)用，對(duì)AlphaFold2軟件的調(diào)優(yōu)不夠熟悉

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生物制藥 分子篩選 動(dòng)力學(xué)模擬 新藥研發(fā) CADD AIDD 苗頭化合物優(yōu)化

某創(chuàng)新靶向藥物公司

應(yīng)用

Gromacs、Rosetta、Vina

場(chǎng)景

分子篩選、動(dòng)力學(xué)模擬、苗頭化合物優(yōu)化

客戶(hù)挑戰(zhàn)

1經(jīng)評(píng)估發(fā)現(xiàn)本地機(jī)房建設(shè)的投資較大且周期較長(zhǎng)，同時(shí)缺乏IT團(tuán)隊(duì)，影響業(yè)務(wù)開(kāi)展，希望有平臺(tái)能快速幫助團(tuán)隊(duì)開(kāi)展研發(fā)業(yè)務(wù)

2CADD團(tuán)隊(duì)最初只有一個(gè)人，希望能有專(zhuān)業(yè)服務(wù)商協(xié)助進(jìn)行軟件的測(cè)試和調(diào)試，同時(shí)提供對(duì)CADD業(yè)務(wù)場(chǎng)景的支持

3需要充足的CPU、GPU等算力資源，同時(shí)希望以低成本方式滿(mǎn)足高峰算力需求

4對(duì)數(shù)據(jù)安全有較高要求，要求計(jì)算環(huán)境私有化，確保數(shù)據(jù)資產(chǎn)安全

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頭部企業(yè) 分子虛篩 靶點(diǎn)結(jié)合

某頭部生物制藥公司

應(yīng)用

Schr?dinger、Vina、Rosetta、Gromacs

場(chǎng)景

小分子篩選

客戶(hù)挑戰(zhàn)

1本地資源有限，項(xiàng)目需求緊迫，需將數(shù)月才能完成的分子篩選任務(wù)壓縮至幾天內(nèi)

2研發(fā)人員對(duì)應(yīng)用了解有限，不懂調(diào)優(yōu)配置，需IT專(zhuān)家提供支持

3IT人員沒(méi)有能力支持研發(fā)所需應(yīng)用的環(huán)境搭建、部署等工作，需要研發(fā)人員自己摸索，人力成本浪費(fèi)較大

4項(xiàng)目預(yù)算有限，希望盡量控制成本完成任務(wù)

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虛擬篩選 開(kāi)源分子庫(kù) 并行化加速 CADD

某上市小分子創(chuàng)新藥企

應(yīng)用

Schr?dinger、LeDock

場(chǎng)景

小分子虛擬篩選

客戶(hù)挑戰(zhàn)

1用戶(hù)不具備海外多分子庫(kù)及大規(guī)模數(shù)據(jù)的下載能力，并且由于多庫(kù)數(shù)據(jù)格式、結(jié)構(gòu)等不同，難以整合與管理多庫(kù)相關(guān)數(shù)據(jù)

2用戶(hù)不熟悉應(yīng)用工具的集群化并行使用，部分工具不支持并行運(yùn)行，單機(jī)運(yùn)行任務(wù)效率低

3本地資源配置低、數(shù)量少，無(wú)法滿(mǎn)足研發(fā)業(yè)務(wù)對(duì)效率的要求

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蛋白質(zhì) AIDD GPU 人工智能

某藥物研發(fā)公司

應(yīng)用

AlphaFold2

場(chǎng)景

蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)

客戶(hù)挑戰(zhàn)

1本地計(jì)算資源有限，多部門(mén)爭(zhēng)搶?zhuān)瑢?dǎo)致許多任務(wù)被推遲，效率不高

2AlphaFold2需要使用GPU來(lái)加速蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)，在實(shí)際業(yè)務(wù)中最多一次需跑十幾個(gè)任務(wù)，并發(fā)需求多，如果按峰值購(gòu)買(mǎi)GPU卡，一次性投入較高

3研發(fā)只了解應(yīng)用，對(duì)AlphaFold2軟件的調(diào)優(yōu)不夠熟悉

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生物制藥 分子篩選 動(dòng)力學(xué)模擬 新藥研發(fā) CADD AIDD 苗頭化合物優(yōu)化

某創(chuàng)新靶向藥物公司

應(yīng)用

Gromacs、Rosetta、Vina

場(chǎng)景

分子篩選、動(dòng)力學(xué)模擬、苗頭化合物優(yōu)化

客戶(hù)挑戰(zhàn)

1經(jīng)評(píng)估發(fā)現(xiàn)本地機(jī)房建設(shè)的投資較大且周期較長(zhǎng)，同時(shí)缺乏IT團(tuán)隊(duì)，影響業(yè)務(wù)開(kāi)展，希望有平臺(tái)能快速幫助團(tuán)隊(duì)開(kāi)展研發(fā)業(yè)務(wù)

2CADD團(tuán)隊(duì)最初只有一個(gè)人，希望能有專(zhuān)業(yè)服務(wù)商協(xié)助進(jìn)行軟件的測(cè)試和調(diào)試，同時(shí)提供對(duì)CADD業(yè)務(wù)場(chǎng)景的支持

3需要充足的CPU、GPU等算力資源，同時(shí)希望以低成本方式滿(mǎn)足高峰算力需求

4對(duì)數(shù)據(jù)安全有較高要求，要求計(jì)算環(huán)境私有化，確保數(shù)據(jù)資產(chǎn)安全

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